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黑英語—小腦篇

為了解決DER EE的問題，作者邱大炮 這樣論述：

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An Integrated Approach For Uncovering Novel DNA Methylation Biomarkers For Non-small Cell Lung Carcinoma

為了解決DER EE的問題，作者VAIBHAV KUMAR SUNKARIA 這樣論述：

Introduction - Lung cancer is one of primal and ubiquitous cause of cancer related fatalities in the world. Leading cause of these fatalities is non-small cell lung cancer (NSCLC) with a proportion of 85%. The major subtypes of NSCLC are Lung Adenocarcinoma (LUAD) and Lung Small Cell Carcinoma (LUS

C). Early-stage surgical detection and removal of tumor offers a favorable prognosis and better survival rates. However, a major portion of 75% subjects have stage III/IV at the time of diagnosis and despite advanced major developments in oncology survival rates remain poor. Carcinogens produce wide

spread DNA methylation changes within cells. These changes are characterized by globally hyper or hypo methylated regions around CpG islands, many of these changes occur early in tumorigenesis and are highly prevalent across a tumor type.Structure - This research work took advantage of publicly avai

lable methylation profiling resources and relevant comorbidities for lung cancer patients extracted from meta-analysis of scientific review and journal available at PubMed and CNKI search which were combined systematically to explore effective DNA methylation markers for NSCLC. We also tried to iden

tify common CpG loci between Caucasian, Black and Asian racial groups for identifying ubiquitous candidate genes thoroughly. Statistical analysis and GO ontology were also conducted to explore associated novel biomarkers. These novel findings could facilitate design of accurate diagnostic panel for

practical clinical relevance.Methodology - DNA methylation profiles were extracted from TCGA for 418 LUAD and 370 LUSC tissue samples from patients compared with 32 and 42 non-malignant ones respectively. Standard pipeline was conducted to discover significant differentially methylated sites as prim

ary biomarkers. Secondary biomarkers were extracted by incorporating genes associated with comorbidities from meta-analysis of research articles. Concordant candidates were utilized for NSCLC relevant biomarker candidates. Gene ontology annotations were used to calculate gene-pair distance matrix fo

r all candidate biomarkers. Clustering algorithms were utilized to categorize candidate genes into different functional groups using the gene distance matrix. There were 35 CpG loci identified by comparing TCGA training cohort with GEO testing cohort from these functional groups, and 4 gene-based pa

nel was devised after finding highly discriminatory diagnostic panel through combinatorial validation of each functional cluster.Results – To evaluate the gene panel for NSCLC, the methylation levels of SCT(Secritin), FOXD3(Forkhead Box D3), TRIM58(Tripartite Motif Containing 58) and TAC1(Tachikinin

1) were tested. Individually each gene showed significant methylation difference between LUAD and LUSC training cohort. Combined 4-gene panel AUC, sensitivity/specificity were evaluated with 0.9596, 90.43%/100% in LUAD; 0.949, 86.95%/98.21% in LUSC TCGA training cohort; 0.94, 85.92%/97.37 in GEO 66

836; 0.91,89.17%/100% in GEO 83842 smokers; 0.948, 91.67%/100% in GEO83842 non-smokers independent testing cohort. Our study validates SCT, FOXD3, TRIM58 and TAC1 based gene panel has great potential in early recognition of NSCLC undetermined lung nodules. The findings can yield universally accurate

and robust markers facilitating early diagnosis and rapid severity examination.

黑英語—用左腦和右腦背好單字(資優篇)

為了解決DER EE的問題，作者邱大炮 這樣論述：

內文介紹：這是一本在教師界、網路上最受好評的單字學習書。這是一本最容易、最快樂、卻讓你忘不掉的單字學習書。這也是一本能幫助你學好英文，讓你的英文突飛猛進，不再害怕英文的學習書。HACK——就是不費吹灰之力，輕鬆劈開學習之門。黑——就是打破常規、不擇手段，只求快速學好英語。這一本超越常規的英語學習書有以下10個特點：一、這是一本最容易、最快樂、卻讓你忘不掉的單字學習書。二、活潑有趣的「情境」與「順口溜」聯想單字學習法，背單字不再枯燥無味。三、由基本單字再衍生其他相近字彙，讓你快樂背1000、再學1000，不怕你背不起來。四、最實用的例句說明，讓你不再只會用破碎的單字與老外溝通。五、讓你不知不

覺，用舌頭記住了所有的單字。六、一本大家可以一起「玩」的單字學習書。七、最詳實的文字說明、最經典的諺語，讓單字不只是單字，他可能是經典文句的一部份，也可能是生活中最常用的俚語，能夠永久停留在你的腦子裡。八、經過嚴謹的統計，在《初級篇》、《中級篇》、《進階篇》、《資優篇》四本書裡，其所收錄的字彙，在大學學測基本字彙的覆蓋率幾乎達100﹪。九、最實用的例句、最好用的諺語、最經典的諺語，讓你所學的單字，成銀、成金、成鑽石。十、本書完全適用基本學測╱高中╱推薦甄試╱大學╱英檢初中級等考試用單字。

結合準確而高效的化學相似物搜尋引擎以及接觸分佈擬合法來挑選能調控新冠病毒框架轉移效率的FDA老藥以阻殺病毒

為了解決DER EE的問題，作者艾哈邁德 這樣論述：

截至論文撰寫之時，世界上超過 50% 的人口已在一年內第三次接種疫苗，以抵禦由冠狀病毒（SARS-CoV2）所引起的百年以來最大的流行病。與每季均能逃避疫苗識別而不斷突變的棘蛋白相比，-1 程序性核醣體移碼 (-1 PRF) 與觸發此PRF機制的 mRNA 假結 (PK)在演化上相對保守許多，包含冠狀病毒在內的病毒屬。因此，科學家們非常感興趣的是可以開發調節PRF的藥物來干擾病毒蛋白的轉譯，進而干擾病毒的複製。儘管科學家已了解PK 的平衡結構及其在核醣體上的位置，但人們仍不清楚 PK 如何的誘導 PRF 產生以及藥物應被設計結合在 PK 中的什麼位置才能增強或減少病毒的移碼效率（FE%）。在

本論文中，我們展示了通過整合小分子對接、分子動力學（MD）模擬和少量藥物的體外篩選，來實現抗 PK 藥物的設計。我們開發了一種新方法：接觸分佈匹配，以有效及省時地找到讓FE%上升或下降的調節劑。這些調節劑是從 2000 多種 FDA 批准的藥物庫中挑選出來的，所以可以讓醫師有機會來off-label使用。接觸分佈由分析一個藥物前十名與SARS-CoV2 PK結合的低能量構型而來，此PK的結構是由冷凍電鏡解析出後，以分子動力學模擬(MD simulations)來鬆弛 (relax) 平衡。通過小分子對接的概率分佈匹配及根據雙螢光素酶測定 (DLA) 所確定現有 FE% 調節劑的證據，我們有效地

擴大了可以篩選的藥物數量。為了支持此平台，我們也開發了化學相似性搜索引擎 SmChem，找出少數可有效調控FE%的 FDA 藥物（老藥新用），並以生化和病毒抑制試驗中來驗證。我們使用此新平台僅對十種藥物進行了篩選，就發現了兩種新的 FE% 變化調節劑，並且該藥在化學結構上不同於已知的調節劑。通過使用光鑷 (OT) 在有或無FE% 調節劑的情況下進一步測試 PK 的機械穩定性和解旋力(unfolding forces)中間體的數量，我們對 PK 的構象可塑性和 PRF 效率之間的相關性提供了新的見解，主要在於FE%增加劑比FE%抑制劑更能減少解旋力中間體的生成但解旋力卻變化不大。這些結果對我們如

何能合理地設計藥物以靶向有翻譯調節功能的 RNA結構提供了一個明確的證據，並提供了一種進化上保守且及時的途徑來使用FDA 已核准的藥物以應對病毒感染。