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Graph Theory and Mobile Communications

為了解決圖論的問題，作者Sengoku, Masakazu 這樣論述：

This comprehensive compendium discusses the basics of graph theory to its application, focusing on the application of graph theory to mobile communications.A mobile communication connects a mobile terminal and a base station wirelessly, and the base station enables communications all over the wor

ld via a wired and satellite communication system. This means that the mobile communication system includes wire and wireless technologies, and also hardware such as analog electric circuits, digital circuits and a software part such as computer algorithms.This useful reference text deeply studies h

ow the network structure influences the performance of the corresponding system.

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晚明的異域知識構設 ——以《三才圖會》裔夷圖譜為討論中心

為了解決圖論的問題，作者劉亞惟 這樣論述：

自《山海經》時代起，遠方異族之想像，就成為古代神話體系的主要內容之一。雖然今日看來，諸多傳說異人充滿著奇幻色彩，它們卻曾長期與域外地理及天下秩序的詮釋相關聯。至晚明時，《山海經》圖像及一組帶有傳奇色彩的異族圖譜的大量刻印，成為一種特殊的時代現象。它們從何而來、為何產生？當時社會又如何理解與定位這些「外夷」記載？晚明士人王圻編纂的類書《三才圖會》，即收錄了大量的「裔夷」圖像。同時，作為一部綜合性類書，書中也收錄了包括天文、地理、鳥獸、珍寶等諸多門類內容，從而構建出一個較為完整的晚明士人的知識空間。本文以《三才圖會．人物卷》中的「裔夷」圖譜為主要討論對象，探討這些頗具傳說色彩的異族記載之來源、流

傳與意義。通過對大食國、小人國、女人國、長人國、狗國、崑崙層期國等傳說個案的梳理，可見異族傳說的產生年代久遠，且在域外交流中始終作為交換的熱門資訊。看似不合理的情節，可能是彼時文化中流行的異域傳說，它們以口傳、文字、圖像等形式，經文化交流而出現於包括中國在內的不同區域的異域記載體系。與民間故事的流傳不同的是，它們常出現在史書或是地理書中，紀錄者往往是官員、僧侶或有域外接觸之人，因此在域外資訊匱乏的時代裡，遠國異人之紀錄，可視為一種時代性的地理志與民族誌。此外，異族傳說在文化交流中的傳播是長期、複雜、多元的。在相同或不同時期內，古阿拉伯、歐洲、蒙古等地均有類似的異族傳說流傳，異族圖像亦有各具特色

又有所關聯的繪製傳統，它們共同反映了一個對異域抱有好奇、恐懼、鄙夷、嚮往等情緒交織的時代圖景。在全球史視野下，成書於晚明的《三才圖會》所處時期，是從古典神話地理、中古傳說地理，至近代地理學萌芽的知識更替中的一個縮影。書中既有前代豐富的域外知識積累，也有更為「新鮮」的域外資訊，如收入〈地理卷〉的傳教士利瑪竇製作的早期世界地圖。西學地理的進入，曾對傳統天下觀帶來了前所未有的衝擊，引起晚明士人對域外及世界地理樣貌的討論。通過對傳說內容的縱向梳理，與不同文化異域記載的橫向比較，《三才圖會》中的遠國異人圖文，反映了一個新舊地理知識並存、中西異域想像碰撞的時代。

研究所講重點【離散數學(下)含歷屆經典試題解析】[適用研究所理工/資訊所、電機所考試](2版)

為了解決圖論的問題，作者林緯 這樣論述：

　　【講重點系列帶你制霸考科】 　　刷考古題之前先讀懂這一本！ 　　面對考試不僅要會解題，更要有紮實基本功！ 　　★ 匯集補教名師多年教學經驗 　　★ 章節編排由淺入深、吸收效率倍增 　　★ 收錄各類經典題型、搭配詳解一點就通 　　這樣的你適合這本書： 　　☆ 新手入門 　　☆ 加強觀念 　　☆ 考前重點複習 　　☆ 專業進修 　　你值得優質的書籍　這本書陪你一起成長！ 　　【講重點×試題大補帖必勝組合】 　　講重點系列觀念解析 + 試題大補帖刷題練習 　　大碩教育提供你全方面的備考戰術！ 　　初階入門、加強複習都適用！ 　　★兩種系列一起閱讀　離上榜之路更近一步★ 　　離散數學是

資訊領域中非常重要的應用數學，也是公認最難準備的一科。其涵蓋範圍相當廣泛，大體而言可區分成四大部分：「基礎數學」、「組合數學計數方法」、「圖形理論與其應用」、「抽象代數與其應用」。有些教科書上還涵蓋了「演算法分析」、「邏輯設計」、「自動機語言」、「波里亞計數」、「編碼解碼」、「作業研究」等等。而因為各個主題並不具備太多相關性，且各教科書強調重點不同，造成同學在這個考科的準備上備感吃力；但也因此，這個科目能否拿到高分，往往就成了是能否高中金榜的重要關鍵。 　　本書收錄國內各大學研究所與各系聖經本教材的離散數學試題，為筆者任教二十餘年的授課教材。書中將離散數學各主題，搭配重點常考題目分類編排，為

同學準備研究所升學考試、校內課程輔助學習的最佳工具。 　　本次改版也換入110與111學年度的考題當作講解範例，讓同學能以最新的考題對照上課重點；同時，本次也將類題區分成即刻可以練習的基本類題、等熟練後再挑戰的進階類題，以及高難度的夢幻類題，同學可以依照個人的學習情況完成各種程度的類題。 本書特色 　　1.內容豐富兼具深度及廣度以深入淺出的方式來表達。 　　2.相關試題收集最完整。 　　3.以最有效且最詳實的方法來解題。 　　4.適合研究所入學考試及自修用的參考書。  

以結構力學統計學習闡明蛋白質功能性質的分子機制

為了解決圖論的問題，作者尼克森 這樣論述：

摘要. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . iAbstract . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . iiTable of Contents . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . iiiList of Figure

s . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . viList of Tables . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . viii1 Introduction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11.1 Research problems . .

. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11.2 Roles of backbone and side chains in protein folding and function . . . . . . . 31.3 Overview of molecular dynamics simulation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41.3.1 Basic Theory . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

. . . . . . 41.3.2 Inter-atomic potentials . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61.4 Coarse-grained approaches of protein simulation . . . . . . . . . . . . . . . . 71.5 Network analysis of proteins . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 81.5.1 Elastic Network Models (

ENM) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 81.5.2 Graph theory to analyze protein structural network . . . . . . . . . . . 91.5.3 Allosteric regulation mechanisms through network based approaches . 101.6 The protein model systems under investigation . . . . . . . . . . . . . . . . . 121.6.1 Seri

ne protease: rat trypsin . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 131.6.2 PDZ3 domain . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 131.7 Outline of research . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 142 Computational Methods . . . . . . . . . . . . . . .

. . . . . . . . . . . . . . . . . 162.1 All-atom molecular dynamic simulations . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 162.2 Parameterization of bsENM by structure-mechanics statistical learning . . . . . 172.2.1 Atomic-to-CG mapping . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 172.2.2 Compu

ting spring constants using fluctuation matching . . . . . . . . . 182.2.3 Determination of optimal lc cutoff . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 192.3 Construction of inter-residue rigidity graphs from statistically learned springconstants . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

. . . . . . . . . 202.4 Similarity analysis of rigidity graphs . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 212.5 Protein rigidity graphs – statistical analysis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 222.5.1 Analysis of the statistical fluctuations of rigidity graph through theirmean-modes . . . .

. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 222.5.2 Calculation of mean-mode contents in an analysis time window . . . . 232.5.3 Identification of prominent eigenmodes of a rigidity graph . . . . . . . 242.6 Calculation of the residue rigidity scores for backbone and side-chains of themode

l proteins . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 252.7 Determination of prominent mechanical responses upon substrate binding/dissociationin the model proteins . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 262.8 Multiple sequence alignment for PDZ3 . . . . . . . .

. . . . . . . . . . . . . . 263 Results and Discussions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 283.1 How does the protein mechanical coupling network differ from the structuraltopology? . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 293.1.1 The co

llective modes of Laplacian matrices are related to skeleton springs 303.1.2 Non-skeleton springs ofKreveal chemically specific patterns in the proteinmechanical coupling network . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 303.1.3 Protein mechanical coupling network is sparse . . . . . . . . . . . . . 3

13.2 Protein mechanical couplings have heavy-tailed and scale-free network properties 323.2.1 The mechanical coupling networks in rat trypsin . . . . . . . . . . . . 333.2.2 The mechanical coupling networks in PDZ3 domain . . . . . . . . . . 343.3 Backbone and side-chain couplings exhibit different

patterns in their mechanicalhotspots . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 353.3.1 Mechanical hotspots of backbone-backbone couplings primarily locatein β-strands . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 363.3.2 Mechanical hotspots of side

-chain-side-chain couplings are different frombackbone-backbone couplings . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 373.3.3 Mechanical hotspots of backbone-side-chain have scattered couplings . 383.4 Emergence of long-range mechanical couplings from the prominent modes inrigidity graphs . . . . .

. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 393.5 Residue rigidity scores defined for backbone and side-chain mechanical couplings– a useful metric for biological functions . . . . . . . . . . . . . . . . . 413.6 Mechanical relay in rat trypsin due to unbinding of BPTI . . . . . . .

. . . . . 433.6.1 The mechanical relay in catalytic domain rearrangement . . . . . . . . 453.6.2 The mechanical relay leads to collapse of calcium-binding loop . . . . 453.6.3 Dynamic allostery from the catalytic domain to the activation domain . 463.7 Mechanical relay in PDZ3 domain due to binding

of CRIPT peptide . . . . . . 473.7.1 Mechanical relay due to hydrogen bonding . . . . . . . . . . . . . . . 473.7.2 Mechanical relay of hydrophobic interactions spread across the β-sandwich 483.7.3 Hotspots in mechanical relay are mostly functional residues . . . . . . 483.7.4 MSA motivated by mecha

nical relay illustrates the evolutionary constraintsof inter-domain allostery . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 494 Conclusions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 515 Figures and Tables . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

. . . 53Bibliography . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89Appendix A 附錄標題. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 109List of Publications . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 116